Jogadores precisam resolver quebra-cabeças e ajudar a avançar na pesquisa do câncer – ScienceDaily

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Cientistas em Barcelona lançaram hoje o GENIGMA, um videogame que convoca os jogadores a resolver quebra-cabeças enquanto gera dados científicos do mundo real que podem detectar alterações nas sequências genômicas e, finalmente, avançar na pesquisa do câncer de mama.

O jogo, lançado hoje para iOS e Android e disponível em inglês, espanhol, catalão e italiano, é o resultado de um projeto de ciência cidadã de dois anos e meio desenvolvido por uma equipe de pesquisadores do Centro de Regulação Genômica. (CRG), o Centro Nacional de Análise Genómica (CNAG-CRG) e profissionais do jogo.

O jogo foi criado para impulsionar os esforços de pesquisa em todo o mundo que dependem de linhagens de células cancerígenas, um recurso crítico usado por cientistas para estudar o câncer e testar novos medicamentos para tratar a doença. Uma das limitações das linhagens de células cancerosas é a falta de mapas de referência do genoma de alta resolução, que são necessários para ajudar os pesquisadores a interpretar seus resultados científicos, por exemplo, identificando a localização de genes de interesse terapêutico ou possíveis locais de mutação.

“As linhas celulares são responsáveis ​​pela descoberta de vacinas, quimioterapias para câncer ou FIV para infertilidade. Isso as torna um pilar da biologia moderna”, explica o professor de pesquisa do ICREA Marc A. Marti-Renom, com dupla afiliação no CRG e CNAG-CRG e cuja pesquisa sustenta o GENIGMA. “No entanto, a falta de mapas de referência do genoma limita o progresso científico atual. É como pedir às pessoas que naveguem pelas cidades modernas usando mapas do passado. Com a ajuda de outras pessoas, podemos atualizar esses mapas, o que nos permitirá progredir rapidamente em pesquisa do câncer de mama.”

O grupo de pesquisa do professor Marti-Renom desenvolveu métodos para criar mapas de referência genômica visualizando o genoma no espaço tridimensional. No entanto, isso requer tempo e recursos significativos para treinar a inteligência artificial, bem como um vasto poder computacional.

Os pesquisadores lançaram o GENIGMA porque acreditam que os dados gerados pelos jogadores podem ser um método mais eficaz de atualizar os mapas de referência em comparação com o uso de IA sozinho. A ‘inteligência de rebanho’ dos jogadores também pode fornecer soluções criativas de maneiras que a IA pode não conseguir.

Para jogar GENIGMA, os jogadores precisam resolver um quebra-cabeça envolvendo uma série de blocos de diferentes cores e formas. Cada string representa uma sequência genética na linhagem de células cancerígenas, e como os jogadores organizam os blocos é uma solução potencial para a localização dos genes.

Os jogadores devem reorganizar os blocos para que atinjam a maior pontuação possível. Quanto maior o número de jogadores e as pontuações mais altas, maior a probabilidade de os pesquisadores encontrarem a sequência correta para esse local específico no mapa de referência.

“Qualquer pessoa com um smartphone de qualquer lugar do mundo pode baixar o GENIGMA gratuitamente e contribuir diretamente com a pesquisa, colocando sua lógica e destreza a serviço da ciência”, afirma Elisabetta Broglio, facilitadora de ciência cidadã do CRG. “A GENIGMA analisará as soluções fornecidas pelos jogadores como um coletivo e não como indivíduos, e aproveitará soluções criativas impossíveis de encontrar com algoritmos determinísticos.”

O primeiro mapa de referência do genoma que os pesquisadores tentarão resolver é para a linhagem de células de câncer de mama T-47D, um dos recursos mais usados ​​na pesquisa do câncer. A equipe de pesquisa do GENIGMA estima que 30 mil jogadores resolvendo em média 50 jogos cada um geraria dados suficientes para revelar o mapa de referência dos 20 mil genes dessa linhagem de células de câncer de mama.

O jogo é lançado hoje com uma campanha de três meses – o #GenigmaChallenge. Toda semana na segunda-feira, por um período total de três meses, a equipe do GENIGMA apresentará novos fragmentos de genoma da linhagem de células T-47D a serem organizados pelos jogadores. Os primeiros fragmentos do genoma que precisam ser organizados são do cromossomo 17, que contém um grande número de genes relacionados ao câncer de mama. Isso inclui o BRCA1, para o qual as mutações foram associadas a cerca de 40% dos cânceres de mama hereditários.

O GENIGMA foi desenvolvido ao longo de dois anos e meio, envolvendo mais de 500 pessoas em 13 workshops. O jogo foi concebido e testado por um grupo diversificado de pessoas de diferentes origens, incluindo pesquisadores, estudantes, professores, artistas, profissionais médicos, bioeticistas, jornalistas, representantes de organizações de pacientes, artistas e desenvolvedores de jogos.

De acordo com Oriol Ripoll, Criativo da JOCS al SEGON e Coordenador da equipe de design de jogos da GENIGMA, “A ciência muitas vezes pode parecer inacessível para a maioria das pessoas, e é por isso que poder pegar o telefone para jogar GENIGMA é tão emocionante. Você não só pode combinar o apelo universal e popularidade dos videogames para contribuir para o avanço da pesquisa médica, você também aprenderá mais sobre ciência.”



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